Spilja Apokalipse (grčki: Σπήλαιο Αποκάλυψης) ili Sveta spilja je hodočasničko svetište na otoku Patmos, koje je 2006. uvršteno na UNESCO-vu Lista mjesta svjetske baštine u Evropi.
Spilja se nalazi na pola puta između Hore i najveće otočke luke Skale, na brdu iznad mora.
To je rupa u stijeni duga 6,60 m, a široka 5,50 m, koja je danas obzidana - tako da predstavlja njeno svetišta. U pećini se ne smije fotografirati, jer je to bio dom Apostola Ivana (Jovana Bogoslova) kad ga je na Patmos prognao rimski car Domicijan. On je u njoj doživio objavu, koju je kasnije izdiktirao svom učeniku Prohorusu, i to je danas posljednja knjiga Novog zavjeta Apokalipsa.
Spilja je osvjetljena sa sedam srebrnih svjetiljaka koje vise sa stropa, a najveća osvjetljava mjesto gdje je navodno sv. Apostol spavao koristeći stijenu kao jastuk. Danas neki od monaha sjedi na toj stijeni i priča turistima priču o Apokalipsi i kako je ona napisana.
Spilja ima nekoliko kamenih niša, po legendi u jednoj od njih je Apostol polagao glavu, a u drugoj plićoj ruke. U jednoj trostruko lomljenoj je čuo glas Boga, preko Svetog Trojstva.
Spilja ima slavu (Panagia Erimitiriou) 26. septembra tad dolaze mnogobrojni hodočasnici slaviti sveto mjesto.
Pored spilje je Makarios Kalogeras - 1713. osnovao bogosloviju koja je imala veliki značaj za Dodekanez.