Muzej Schnütgen (njemački: Museum Schnütgen) je muzej za srednjovjekovne umjetnosti koji se nalazi u njemačkom gradu Kölnu. Ime je dobio po njemačkom svećeniku i teologu Alexanderu Schnütgenu (1843 - 1918) koji je gradu 1906. poklonio svoju zbirku srednjovjekovnih i antičkih artefakata koja je postala temelj njegovih eksponata. Od 1956. se muzej nalazi u romaničkoj crkvi St. Cäcilien.